В Москве ни в какие агенства не вздумайте обращаться. Если нет лишних 3-4 штук зелени. Обдерут как липку.
На Галапагосы летают как минимум 2 эквадорских компании, одна Tame, вторая уже забыл как называется, у Tame минимум 2 рейса в день Кито-Гуаякиль-Бальтра.
если правильно помню, летит первый самолёт в 9 утра, второй в 10, это из Кито. Если я ничего не путаю.
Можно вообще лететь до Гуаякиля (в смысле брать билет Москва-Гуаякиль, если KLM, т.к. он сначала делает посадку в Гуаякиле, а потом уже летит в Кито) и оттуда Гуаякиль-Бальтра летит фактически пустой.
Но вообще суточный перелет это конечно чудовищно, ребенок возможно даже меньше устанет кстати
(наша была как огурчик даже после обратного перелета из Кито в Москву, а он тяжелее).
Я бы советовал воспользоваться нашими местными туроператорами Дефисом или Сусаниным, они вам забронируют отель в Кито и билеты на Галапагос. Но это вообще не проблема, а вот бронировать отель на галапагосах (либо яхт-тур) надо обязательно заранее, и это они вам тоже сделают.
Долетите до Кито - отдохнёте сутки. Отдыхать надо! А то вам никаких галапагосов не захочется.