До Лимы не подскажу , а до Боготы без вопросов - я ездил.
Ехать из Кито до Тулькана , переходите границу , на другой стороне берете другой автобус до Боготы.
Граница была весьма прозрачная , так что с первого раза можно пройти не заметив. В силу ужесточившегося контроля границы с северным соседом , думаю такое уже вряд ли случиться , но кто их знает
Есть на Колоне в Кито автобусная станция , рядом с Банко де Гуаякиль, там продают билеты прямо до Боготы. Не ездил , но говорят что удобство относительное , они просто резервируют билеты на колумбийский автобус , то есть все остальное все равно придеться делать самостоятельно. За услуги свои естественно хотят денюжку. Возможно что-то изменилось , может быть стало удобнее , лучше у них спросить как обстоят дела сейчас.
Удач